هدف شهرك فناوري ارتقاء صنعت غذايي استان خراسان جهت رقابت در بازارهاي بين المللي، ورود به سازمان تجارت جهاني و تبديل اين منطقه به قطب صادر كننده مواد غذايي با ارزش افزوده بالا مي باشد. همچنين مساعدت به شكل گيري صنايع مبتني بر بيوتكنولوژي در استان هدف ديگر شهرك است.

رسالت مهم شهرك ارتقاء نقش استان خراسان به يكي از مهمترين صادر كنندگان محصولات غذايي با ارزش افزوده بالا در منطقه خاور ميانه است.
رسالت ديگر اين شهرك، كاهش شكاف تكنولوژيك، ادغام فناوريهاي پيشرفته بيوتكنولوژي در صنايع غذايي و ارتقاء توان رقابتي اين صنعت ميباشد. لذا با توجه به مشكلاتي كه تاكنون در سطح كشور در اين زمينه وجود داشته از قبيل توان رقابتي نسبتا پايين براي حضور در بازارهاي جهاني، بهره مند نشدن كشور از ارزش افزوده كالاهاي غذايي و كشاورزي، مشكل بسته بندي محصولات توليدي، محدوديتهاي مديريتي و فقدان ساختارهاي سازماني توانمند و منعطف و ... كه باعث عدم ارتقاء نسبي قابليتهاي فناوري شده است.